Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NESP48681 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NESP48681 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NESP48681 SNORA30.1-201ENST00000363193 129 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NESP48681 RNA5SP84-201ENST00000364740 107 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NESP48681 AC053503.4-201ENST00000431827 224 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NESP48681 AC108879.1-201ENST00000438026 828 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NESP48681 AC112694.1-202ENST00000540985 943 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NESP48681 PMM2-216ENST00000569958 698 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NESP48681 AC021072.1-201ENST00000635789 835 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NESP48681 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NESP48681 PIN4-203ENST00000373669 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NESP48681 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NESP48681 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NESP48681 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NESP48681 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NESP48681 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NESP48681 AC008080.1-201ENST00000311067 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NESP48681 MT-ND6-201ENST00000361681 525 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NESP48681 AL137077.1-201ENST00000442115 528 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NESP48681 FTH1-205ENST00000529631 507 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NESP48681 RAB42P1-201ENST00000555078 316 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NESP48681 AC032044.1-201ENST00000570924 570 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NESP48681 NSRP1-213ENST00000584423 482 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NESP48681 AC008894.2-202ENST00000599676 1027 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NESP48681 AC112702.1-201ENST00000623712 366 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NESP48681 AL139220.2-222ENST00000627999 756 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NESP48681 AL590094.1-206ENST00000635959 478 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NESP48681 AL590094.1-209ENST00000637260 499 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NESP48681 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NESP48681 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NESP48681 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NESP48681 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NESP48681 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NESP48681 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NESP48681 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NESP48681 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NESP48681 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NESP48681 IGHE-202ENST00000641420 1485 ntAPPRIS P5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NESP48681 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NESP48681 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NESP48681 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NESP48681 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NESP48681 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NESP48681 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NESP48681 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NESP48681 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NESP48681 RPS6-201ENST00000315377 863 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NESP48681 CAV2-202ENST00000343213 776 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NESP48681 HAX1-204ENST00000457918 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NESP48681 AC008982.1-201ENST00000594769 963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NESP48681 AC006273.1-201ENST00000606966 861 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NESP48681 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NESP48681 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NESP48681 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NESP48681 DEGS1-202ENST00000391877 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NESP48681 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NESP48681 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NESP48681 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NESP48681 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NESP48681 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NESP48681 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NESP48681 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NESP48681 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NESP48681 RN7SL76P-201ENST00000482435 289 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NESP48681 HNRNPA1P11-201ENST00000580106 956 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NESP48681 RN7SL460P-201ENST00000582806 258 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NESP48681 PDLIM1P1-201ENST00000604187 969 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NESP48681 CD74-201ENST00000009530 981 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NESP48681 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NESP48681 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NESP48681 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NESP48681 MIR100HG-219ENST00000533109 1794 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NESP48681 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NESP48681 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NESP48681 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NESP48681 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NESP48681 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NESP48681 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NESP48681 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NESP48681 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NESP48681 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NESP48681 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NESP48681 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NESP48681 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NESP48681 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NESP48681 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NESP48681 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NESP48681 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NESP48681 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NESP48681 OR52N1-201ENST00000317078 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NESP48681 SGCA-202ENST00000344627 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NESP48681 NAA10-205ENST00000393712 908 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NESP48681 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NESP48681 RNA5SP407-201ENST00000410275 110 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NESP48681 PHBP3-201ENST00000412562 819 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NESP48681 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NESP48681 RASGRF2-AS1-202ENST00000505694 535 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NESP48681 AC009646.2-202ENST00000524425 826 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NESP48681 AC022966.2-201ENST00000587434 367 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms