Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 NMRAL2P-204ENST00000423298 1792 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 GRM4-209ENST00000609222 3176 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 ARHGEF9-226ENST00000636392 1920 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 CYP4F11-205ENST00000620614 2908 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 FAM198B-207ENST00000592057 3425 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 CEACAM20-203ENST00000614924 1809 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 PSMD2-205ENST00000435761 2574 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 ITFG2-201ENST00000228799 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 TEX35-203ENST00000367641 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 SLC5A11-201ENST00000347898 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 FERMT2-202ENST00000343279 3247 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 LGR6-203ENST00000367278 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 GRIP2-206ENST00000637182 3727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 SPCS2-209ENST00000610881 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 SLC11A1-201ENST00000233202 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 EDARADD-204ENST00000637660 2803 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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