Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
O00370 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms