Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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