Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 KRTAP10-12-201ENST00000400365 873 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 SEPT7P2-208ENST00000444755 505 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 CDHR4-205ENST00000487256 1017 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AC010931.3-201ENST00000561647 554 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 LINC01137-201ENST00000424989 1395 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 OAZ3-201ENST00000321531 851 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 SUGT1-202ENST00000343788 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AL049542.1-201ENST00000430231 278 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AL355500.1-201ENST00000439421 297 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 LINC01664-202ENST00000441544 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 IGKV2-28-201ENST00000482769 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 KRT18P40-201ENST00000599859 1571 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms