Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRC7

PLCD4, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCD4Q9BRC7 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 PDE5A-202ENST00000354960 7154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 ST6GAL2-201ENST00000361686 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 MAML3-203ENST00000509479 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PLCD4Q9BRC7 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLCD4Q9BRC7 C15orf40-201ENST00000304177 11244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLCD4Q9BRC7 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLCD4Q9BRC7 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLCD4Q9BRC7 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLCD4Q9BRC7 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLCD4Q9BRC7 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLCD4Q9BRC7 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLCD4Q9BRC7 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLCD4Q9BRC7 SRRT-215ENST00000614484 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLCD4Q9BRC7 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLCD4Q9BRC7 HERC2P10-201ENST00000570209 2393 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
PLCD4Q9BRC7 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLCD4Q9BRC7 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLCD4Q9BRC7 TPX2-202ENST00000340513 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLCD4Q9BRC7 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLCD4Q9BRC7 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLCD4Q9BRC7 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PLCD4Q9BRC7 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PLCD4Q9BRC7 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLCD4Q9BRC7 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLCD4Q9BRC7 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLCD4Q9BRC7 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLCD4Q9BRC7 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLCD4Q9BRC7 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLCD4Q9BRC7 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLCD4Q9BRC7 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PLCD4Q9BRC7 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLCD4Q9BRC7 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLCD4Q9BRC7 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms