Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FXNQ16595 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FXNQ16595 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FXNQ16595 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FXNQ16595 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FXNQ16595 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FXNQ16595 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FXNQ16595 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FXNQ16595 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FXNQ16595 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FXNQ16595 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FXNQ16595 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FXNQ16595 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FXNQ16595 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FXNQ16595 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FXNQ16595 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FXNQ16595 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FXNQ16595 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FXNQ16595 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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FXNQ16595 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FXNQ16595 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FXNQ16595 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FXNQ16595 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FXNQ16595 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FXNQ16595 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FXNQ16595 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FXNQ16595 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FXNQ16595 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FXNQ16595 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FXNQ16595 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FXNQ16595 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FXNQ16595 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FXNQ16595 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FXNQ16595 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FXNQ16595 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FXNQ16595 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FXNQ16595 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FXNQ16595 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FXNQ16595 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FXNQ16595 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FXNQ16595 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FXNQ16595 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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FXNQ16595 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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FXNQ16595 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FXNQ16595 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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FXNQ16595 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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FXNQ16595 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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FXNQ16595 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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FXNQ16595 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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FXNQ16595 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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FXNQ16595 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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FXNQ16595 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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