Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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CBFBQ13951 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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CBFBQ13951 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
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CBFBQ13951 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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