Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
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