Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED6P86452 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms