Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 PLEKHM1P1-205ENST00000582986 5014 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 CCDC14-220ENST00000488653 4156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 SFMBT2-201ENST00000361972 7922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 SIGLEC1-201ENST00000344754 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 NBPF1-203ENST00000430580 5932 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 TMEM56-201ENST00000370203 6822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 GPRASP1-201ENST00000361600 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 AKNA-201ENST00000223791 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 NBN-201ENST00000265433 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 MAGEL2-201ENST00000532292 4298 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 SLC6A1-201ENST00000287766 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 POLE-201ENST00000320574 7840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 AP002008.2-201ENST00000635926 4870 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 NOL4L-203ENST00000359676 5991 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PLNP26678 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms