Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms