Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LIG1P18858 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LIG1P18858 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LIG1P18858 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LIG1P18858 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LIG1P18858 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LIG1P18858 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LIG1P18858 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LIG1P18858 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LIG1P18858 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LIG1P18858 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LIG1P18858 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LIG1P18858 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LIG1P18858 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LIG1P18858 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LIG1P18858 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LIG1P18858 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LIG1P18858 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LIG1P18858 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LIG1P18858 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LIG1P18858 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LIG1P18858 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LIG1P18858 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LIG1P18858 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LIG1P18858 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LIG1P18858 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LIG1P18858 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms