Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BRAFP15056 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms