Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms