Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

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Length 1,298 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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AMBRA1Q9C0C7 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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AMBRA1Q9C0C7 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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AMBRA1Q9C0C7 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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AMBRA1Q9C0C7 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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AMBRA1Q9C0C7 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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AMBRA1Q9C0C7 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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AMBRA1Q9C0C7 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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AMBRA1Q9C0C7 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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AMBRA1Q9C0C7 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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