Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM55Q9BYV6 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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