Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AC097474.1-201ENST00000506481 1371 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AL590491.2-202ENST00000611126 418 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 ZNF268-208ENST00000539248 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 ZNF268-212ENST00000542711 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 GOSR2-231ENST00000640007 1425 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AACSP1-202ENST00000521412 1095 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms