Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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SYCP1Q15431 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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SYCP1Q15431 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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SYCP1Q15431 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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SYCP1Q15431 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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SYCP1Q15431 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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