Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms