Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
EP300Q09472 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 WDR54-202ENST00000409791 854 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 AC079325.1-201ENST00000430386 857 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 FAM157A-201ENST00000437428 1141 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 AC007881.1-201ENST00000437460 187 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 LINC02507-201ENST00000509370 1028 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 ABCC6P2-201ENST00000526069 590 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 AL627095.1-201ENST00000414775 321 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 RN7SL340P-201ENST00000470792 296 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 TMEM154-202ENST00000504064 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EP300Q09472 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms