Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 AC022784.6-202ENST00000523246 674 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms