Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms