Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD1P28340 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD1P28340 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD1P28340 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD1P28340 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD1P28340 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD1P28340 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD1P28340 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD1P28340 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD1P28340 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms