Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 ZNF564-201ENST00000339282 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 KLHL12-203ENST00000367261 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 MPP4-203ENST00000396886 2250 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 SLC44A4-202ENST00000229729 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 CLINT1-201ENST00000411809 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 MISP-201ENST00000215582 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 MCU-204ENST00000536019 3224 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 SMG8-202ENST00000543872 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 XRCC3-202ENST00000553264 3018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 NEK11-209ENST00000510688 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 SLC45A2-202ENST00000382102 2723 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 COX7A2L-202ENST00000378669 3056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 DNAH2-202ENST00000570791 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 PYGM-201ENST00000164139 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 ALDH1L1-202ENST00000393431 2797 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms