Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GM2AP17900 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GM2AP17900 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GM2AP17900 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GM2AP17900 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GM2AP17900 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GM2AP17900 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GM2AP17900 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GM2AP17900 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GM2AP17900 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GM2AP17900 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GM2AP17900 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GM2AP17900 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GM2AP17900 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GM2AP17900 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GM2AP17900 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GM2AP17900 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GM2AP17900 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GM2AP17900 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GM2AP17900 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GM2AP17900 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GM2AP17900 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GM2AP17900 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GM2AP17900 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GM2AP17900 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GM2AP17900 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GM2AP17900 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GM2AP17900 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GM2AP17900 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GM2AP17900 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GM2AP17900 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GM2AP17900 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GM2AP17900 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GM2AP17900 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GM2AP17900 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GM2AP17900 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GM2AP17900 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GM2AP17900 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GM2AP17900 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GM2AP17900 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GM2AP17900 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GM2AP17900 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GM2AP17900 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GM2AP17900 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GM2AP17900 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GM2AP17900 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GM2AP17900 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GM2AP17900 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GM2AP17900 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GM2AP17900 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GM2AP17900 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GM2AP17900 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GM2AP17900 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GM2AP17900 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GM2AP17900 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GM2AP17900 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GM2AP17900 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GM2AP17900 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GM2AP17900 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GM2AP17900 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GM2AP17900 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GM2AP17900 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GM2AP17900 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GM2AP17900 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GM2AP17900 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GM2AP17900 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GM2AP17900 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GM2AP17900 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GM2AP17900 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GM2AP17900 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GM2AP17900 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
GM2AP17900 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GM2AP17900 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GM2AP17900 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GM2AP17900 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GM2AP17900 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GM2AP17900 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GM2AP17900 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GM2AP17900 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GM2AP17900 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GM2AP17900 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GM2AP17900 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GM2AP17900 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GM2AP17900 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GM2AP17900 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GM2AP17900 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GM2AP17900 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GM2AP17900 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GM2AP17900 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GM2AP17900 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GM2AP17900 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GM2AP17900 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GM2AP17900 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GM2AP17900 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GM2AP17900 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GM2AP17900 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GM2AP17900 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GM2AP17900 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GM2AP17900 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GM2AP17900 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms