Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms