Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GOLGA6L4A6NEF3 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GOLGA6L4A6NEF3 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GOLGA6L4A6NEF3 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms