Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms