Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms