Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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