Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
IHHQ14623 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
IHHQ14623 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
IHHQ14623 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IHHQ14623 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IHHQ14623 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
IHHQ14623 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
IHHQ14623 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IHHQ14623 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IHHQ14623 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IHHQ14623 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IHHQ14623 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
IHHQ14623 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
IHHQ14623 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
IHHQ14623 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
IHHQ14623 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
IHHQ14623 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
IHHQ14623 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
IHHQ14623 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
IHHQ14623 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
IHHQ14623 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
IHHQ14623 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IHHQ14623 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IHHQ14623 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IHHQ14623 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IHHQ14623 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
IHHQ14623 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IHHQ14623 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IHHQ14623 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
IHHQ14623 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IHHQ14623 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IHHQ14623 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IHHQ14623 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
IHHQ14623 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IHHQ14623 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IHHQ14623 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IHHQ14623 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IHHQ14623 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms