Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms