Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms