Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFI35P80217 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFI35P80217 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFI35P80217 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IFI35P80217 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IFI35P80217 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFI35P80217 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
IFI35P80217 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
IFI35P80217 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IFI35P80217 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFI35P80217 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFI35P80217 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFI35P80217 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
IFI35P80217 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFI35P80217 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFI35P80217 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IFI35P80217 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IFI35P80217 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
IFI35P80217 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IFI35P80217 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IFI35P80217 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
IFI35P80217 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IFI35P80217 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFI35P80217 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFI35P80217 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFI35P80217 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFI35P80217 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFI35P80217 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFI35P80217 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFI35P80217 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFI35P80217 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFI35P80217 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFI35P80217 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFI35P80217 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFI35P80217 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IFI35P80217 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFI35P80217 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFI35P80217 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFI35P80217 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFI35P80217 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFI35P80217 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms