Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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CENPFP49454 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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CENPFP49454 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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CENPFP49454 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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CENPFP49454 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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CENPFP49454 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPFP49454 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
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