Protein–RNA interactions for Protein: P47804

RGR, RPE-retinal G protein-coupled receptor, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGRP47804 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RGRP47804 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RGRP47804 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RGRP47804 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RGRP47804 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RGRP47804 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RGRP47804 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RGRP47804 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RGRP47804 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RGRP47804 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RGRP47804 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RGRP47804 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RGRP47804 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RGRP47804 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RGRP47804 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RGRP47804 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RGRP47804 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RGRP47804 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RGRP47804 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RGRP47804 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RGRP47804 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RGRP47804 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RGRP47804 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RGRP47804 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RGRP47804 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RGRP47804 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RGRP47804 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RGRP47804 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RGRP47804 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RGRP47804 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RGRP47804 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RGRP47804 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RGRP47804 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RGRP47804 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RGRP47804 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RGRP47804 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RGRP47804 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RGRP47804 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RGRP47804 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RGRP47804 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RGRP47804 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RGRP47804 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RGRP47804 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RGRP47804 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RGRP47804 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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