Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SOBPA7XYQ1 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SOBPA7XYQ1 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SOBPA7XYQ1 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SOBPA7XYQ1 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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