Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms