Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms