Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR4

FAM19A4, Protein FAM19A4, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM19A4Q96LR4 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms