Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms