Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 NAT9-219ENST00000582524 573 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms