Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms