Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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TRAPPC6BQ86SZ2 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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TRAPPC6BQ86SZ2 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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TRAPPC6BQ86SZ2 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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TRAPPC6BQ86SZ2 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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TRAPPC6BQ86SZ2 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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TRAPPC6BQ86SZ2 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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TRAPPC6BQ86SZ2 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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TRAPPC6BQ86SZ2 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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TRAPPC6BQ86SZ2 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TRAPPC6BQ86SZ2 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TRAPPC6BQ86SZ2 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TRAPPC6BQ86SZ2 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TRAPPC6BQ86SZ2 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TRAPPC6BQ86SZ2 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TRAPPC6BQ86SZ2 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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