Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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SIX1Q15475 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
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SIX1Q15475 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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