Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms