Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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CUL4AQ13619 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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CUL4AQ13619 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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CUL4AQ13619 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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CUL4AQ13619 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4AQ13619 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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