Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms