Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UTRNP46939 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UTRNP46939 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UTRNP46939 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UTRNP46939 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UTRNP46939 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UTRNP46939 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UTRNP46939 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UTRNP46939 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UTRNP46939 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UTRNP46939 DEGS1-202ENST00000391877 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UTRNP46939 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UTRNP46939 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UTRNP46939 MIR7704-201ENST00000610524 59 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
UTRNP46939 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UTRNP46939 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UTRNP46939 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UTRNP46939 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UTRNP46939 AL049542.1-201ENST00000430231 278 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
UTRNP46939 ACTG1P23-201ENST00000437653 1074 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
UTRNP46939 AL157823.2-201ENST00000452048 669 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UTRNP46939 AC007405.2-203ENST00000455988 547 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UTRNP46939 PARVG-208ENST00000466375 820 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UTRNP46939 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UTRNP46939 AC142381.4-201ENST00000566806 702 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UTRNP46939 AC142086.5-201ENST00000567619 702 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UTRNP46939 RN7SL322P-201ENST00000583519 299 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
UTRNP46939 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
UTRNP46939 AC245427.1-201ENST00000633705 760 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UTRNP46939 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UTRNP46939 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTRNP46939 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTRNP46939 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTRNP46939 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTRNP46939 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTRNP46939 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTRNP46939 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTRNP46939 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTRNP46939 AP001979.1-201ENST00000529222 751 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UTRNP46939 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTRNP46939 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UTRNP46939 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTRNP46939 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTRNP46939 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTRNP46939 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTRNP46939 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTRNP46939 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTRNP46939 AL137077.1-201ENST00000442115 528 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UTRNP46939 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTRNP46939 AC068858.1-201ENST00000525114 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTRNP46939 BMS1P8-203ENST00000567036 614 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTRNP46939 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTRNP46939 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTRNP46939 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTRNP46939 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTRNP46939 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTRNP46939 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTRNP46939 IMPDH1P5-201ENST00000439688 1540 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UTRNP46939 ATP6V1B1-AS1-201ENST00000422761 1129 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTRNP46939 AP000959.1-201ENST00000441759 977 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTRNP46939 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTRNP46939 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTRNP46939 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTRNP46939 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTRNP46939 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTRNP46939 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTRNP46939 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTRNP46939 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTRNP46939 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTRNP46939 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTRNP46939 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTRNP46939 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTRNP46939 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTRNP46939 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTRNP46939 GAPDHP65-201ENST00000425487 1006 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
UTRNP46939 TUBB4A-207ENST00000596926 548 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTRNP46939 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTRNP46939 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTRNP46939 FAHD2A-204ENST00000447036 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTRNP46939 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTRNP46939 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTRNP46939 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTRNP46939 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTRNP46939 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTRNP46939 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTRNP46939 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTRNP46939 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTRNP46939 AC069277.1-201ENST00000433639 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTRNP46939 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
UTRNP46939 AC017100.1-201ENST00000565978 1169 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
UTRNP46939 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTRNP46939 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTRNP46939 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UTRNP46939 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UTRNP46939 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UTRNP46939 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UTRNP46939 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UTRNP46939 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UTRNP46939 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UTRNP46939 SGCA-202ENST00000344627 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms